¿De qué forma me conviene cobrar?, en la provincia de Madrid (28110)

Buenas.

Actualmente estoy trabajando por cuenta ajena para una empresa, y al mismo tiempo haciendo un proyecto web para otra, que aún no me ha sido remunerado.
Esta segunda empresa requiere de mis servicios por un tiempo más prolongado y me encuentro ante tres opciones:
1ª me ofrece un contrato a media jornada, pero esto creo que no me interesa porque al tener otro pagador Hacienda me va a dar un palo tremendo.
2ª hacerme autónomo y facturar mis servicios. Adicionalmente a esto, me ofrece un sueldo fijo al mes que se sumaría a un porcentaje de las ganancias de cada proyecto en el que participe. El problema es que la cuota de autónomo es excesivamente alta y casi igual que el sueldo que me ofrecen, por lo que sólo ganaría el porcentaje de beneficios si los hubiera.
3ª por último, me ofrece una participación del 10% de la sociedad, con cuenta de gastos, y que todas mis ganancias se ingresarían en dicha cuenta hasta el momento de poder facturarlas.

¿Cuál sería la forma menos perjudicial para mi de cobrar lo que me ofrecen?